インシリコデザインプロジェクト

メンバー

研究目的・背景

本プロジェクトは、大量のデータからヒントを見つける情報学（インフォマティクス）の技術と、病気の原因となるタンパク質などが、薬の候補となる分子を「どうやって見つけ、結びつくか」を分子の形と動きから紐解く構造シミュレーション技術を融合させ、生命の基本的な仕組みの理解に基づいた、理にかなった創薬研究開発を推進します。所内、他機関、大学と連携し、低分子に留まらず、中・高分子といった多様なモダリティに対応した医薬品設計技術を確立し、あらゆる創薬標的に対して、素早く正確に医薬品候補分子を創出することを目指します。

研究概要

データ統合基盤の開発と創薬応用

有効な薬の作り方が見つからず手つかずになっている魅力的な創薬標的候補を攻略するために、世界中で利用可能な生命科学のデータを集めて解析するプラットフォームの研究開発を推進します。それにより、病気に関わる標的候補が体内でどのような「つながり（ネットワーク）」を持っているかを詳しく探ることを可能にし、最も有効な標的を絞り込み、実験による評価を効率的に進めることで、新しい薬づくりを大きく加速させることを目指します。

構造モデリング基盤の開発と創薬応用

薬の標的となる分子の「形」を利用した構造ベース創薬の開発研究を推進します。AIや分子シミュレーション技術を活用し、病気の原因となる分子同士が体内で「どのように結びつくか」という、複雑な動きを正確に可視化する構造モデリング技術を開発することで、生命の仕組みを深く理解し、それに基づいた新しい薬づくりを実現することを目指します。

(参考文献)

1. Yi-An Chen, Hitoshi Kawashima, Jonguk Park, et al. “NIBN Japan Microbiome Database, a Database for Exploring the Correlations between Human Microbiome and Health.” Scientific Reports 15, (2025): 19640. https://doi.org/10.1038/s41598-025-04339-z
2. Yi-An Chen, Rodolfo S Allendes Osorio, and Kenji Mizuguchi. “TargetMine 2022: A New Vision into Drug Target Analysis.” Bioinformatics 38, (2022): 4454–56. https://doi.org/10.1093/bioinformatics/btac507
3. Yuhi Hosoe, Yohei Miyanoiri, Suyong Re, et al. “Structural Dynamics of the N‐terminal SH2 Domain of PI3K in Its Free and CD28 ‐bound States.” The FEBS Journal, 290, (2022): 2366-2378. https://doi.org/10.1111/febs.16666
4. Daiki Yamane, Satsuki Onitsuka, Suyong Re, et al. “Selective Covalent Targeting of SARS-CoV-2 Main Protease by Enantiopure Chlorofluoroacetamide.” Chemical Science 13, (2022): 3027–34. https://doi.org/10.1039/D1SC06596C
5. Taro Tsuji, Kayoko Hashiguchi, Mana Yoshida, et al. “α-Amino Acid and Peptide Synthesis Using Catalytic Cross-Dehydrogenative Coupling.” Nature Synthesis 1, (2022): 304–12. https://doi.org/10.1038/s44160-022-00037-0
6. Suyong Re, and Kenji Mizuguchi. “Glycan Cluster Shielding and Antibody Epitopes on Lassa Virus Envelop Protein.” The Journal of Physical Chemistry B 125, (2021): 2089–97. https://doi.org/10.1021/acs.jpcb.0c11516

連絡先

リンク

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